北京大学昌平校区位于北京市昌平区西北4公里的天寿山下，始建于上世纪50年代末, 因当时其工程代号为60-200#，故俗称200号校区。作为北大理科新校址，在这里曾经诞生了我国第一台原子钟，第一只返波管，第一片大规模集成电路，第一台百万次计算机……

校区占地面积550余亩，已有建筑面积5.6万平方米，校区1980年-1998年曾一度由国家教育行政学院（原中央教育行政学院）使用。上世纪90年代初，北京大学收回昌平校区的使用权。1994-1999年间，学校文科一年级新生迁入昌平校区，2000年之后成为学校成人教育学院的办学基地。

2007年，北京大学做出决定，对昌平园区的功能定位进行调整，从教育培训转变为科学研究基地。2008年年底，学校成立昌平校区管理办公室，要把昌平校区建设成集大科学装置、开放性公共科研平台、国家重大科研项目和国家重点实验室于一体的科学研究基地，建设成基础研究向实际应用转化的研发平台。